TIPOS DE INFECCIÓN | MUESTRA |
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Bacteriemia | Sangre (más muestra del posible foco) |
Infecciones cardiovasculares y asociadas a dispositivos intravasculares | |
Sistema nervioso central | |
Meningitis-encefalitis | LCR, hemocultivo |
Absceso cerebral | Aspirado del absceso |
Tracto respiratorio | |
Faringoamigdalitis | Exudado faríngeo |
Estudio de portador de S.aureus | Nasal |
Estudio de portador de gonococo | Exudado faríngeo |
Sinusitis | Aspirado sinusal |
Otitis media | Tímpanocentesis |
Otitis externa | Exudado oído externo |
Neumonía | Hemocultivo, esputo, BAS, BAL, CTO, punción transtorácica |
Empiema y abscesos pulmonares | Líquido pleural, aspirado absceso |
Tosferina | Lavado nasofaríngeo / exudado nasofaríngeo |
Infecciones oculares | |
Conjuntivitis | Exudado conjuntival / raspado |
Queratitis | Raspado corneal |
Queratitis por lentillas | Raspado corneal, lentilla y líquido de lentillas |
Endoftalmitis | Líquido intraocular |
Infecciones gastrointestinales | |
Diarrea | Heces/biopsia intestinal/aspirado duodenal |
Infecciones intraabdominales | |
Peritonitis | Líquido peritoneal |
Abscesos intraperitoneales o viscerales | Aspirado absceso |
Colecistitis | Aspirado biliar, hemocultivo |
Infección del tracto urinario | |
Infección de orina | Orina por micción limpia o sondaje |
Tracto genital | |
Cervicitis | Exudado endocervical |
Detección de Streptococcus agalactiae | Exudado vágino-rectal, vaginal o rectal |
Nódulos genitales | Aspirado nódulo |
Prostatitis | Secreción prostática |
Úlceras genitales | Frotis úlcera |
Uretritis | Exudado uretral |
Verrugas genitales | Frotis verruga, biopsia |
Virus del papiloma humano (VPH) | Exudado endocervical o vulvar |
Vulvovaginitis | Exudado vaginal |
Piel y tejidos blandos | |
Impétigo, foliculitis, erisipela, celulitis, úlceras, gangrena, abscesos cutáneos, heridas y quemaduras | Aspirados tomados con jeringa y biopsia de tejido. |
Huesos y articulaciones | |
Artritis | Líquido sinovial |
Osteomielitis | Biopsia ósea o exudado |
Prótesis | Exudado |
Normas generales: Las torundas con medio de transporte sólido han sido sustituidas por torundas con medio de transporte líquido, lo que permite tanto la siembra convencional como como las determinaciones moleculares. Todas las muestras que se recojan en estas torundas pueden mantenerse a temperatura ambiente/4ºC hasta su envío al laboratorio de microbiología. Las biopsias nunca deben enviarse en formol. |
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MUESTRA | DETERMINACIÓN | ENVASE | COMENTARIOS |
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Abscesos | Bacterias (cultivo) | Jeringa ocluida (sin aguja), frascos de hemocultivo, tioglicolato, envase estéril. Menos recomendado: torunda en medio líquido de Stuart o Amies |
Transporte inmediato al laboratorio Tomar la muestra tras limpieza y desinfección adecuada. Siempre que sea posible, obtener la muestra por aspiración. Las muestras de abscesos pueden inocularse en frasco de hemocultivo, aunque es conveniente en este caso enviar además muestra para su siembra directa en placas. Poco recomendable las recogidas con escobillón. |
Aspirado duodenal | Giardia spp.(microscopía) Strongyloides spp. | Envase estéril de boca ancha, previamente calentado a 37ºC. | Trasporte inmediato al laboratorio. Si la muestra se enfría es difícil observar los trofozoítos de Giardia |
Aspirado/exudado nasofaríngeo | Bacterias (cultivo/PCR)
Virus, Chlamydia spp., Mycoplasma spp. Inmunocromatografía, PCR
Panel sindrómico de vias altas (PCR multiplex) |
Envase estéril/torunda flexible en medio líquido de Stuart o Amies para estudio bacteriano
Envase estéril con medio UTM: para estudio molecular de virus respiratorios. Menos recomendado: medio líquido de Stuart o Amies
Envase estéril/ Envase estéril con medio UTM |
Aspirado: envase estéril Exudado nasofaríngeo: torunda flexible en el medio líquido que proceda (bacterias o virus) |
Aspirado oído medio (timpanocentesis) | Bacterias/hongos (cultivo) | Envase estéril, jeringa ocluida (sin aguja) | Enviar inmediatamente al laboratorio |
Aspirado sinusal | Bacterias/hongos (cultivo) | Jeringa (enviar sin aguja) o inocular en un tubo de tioglicolato |
Enviar inmediatamente al laboratorio No válido exudado nasal |
Aspirado traqueal | Bacterias, hongos (cultivo) |
Envase estéril de boca ancha | |
BAS, BAL | Bacterias, hongos (cultivo) |
Envase estéril de boca ancha | BAL: enviar de 10-100 ml |
Biopsias y tejidos | Bacterias/hongos (cultivo) Virus (PCR) Micobacterias (tinción, cultivo) |
Envase estéril de boca ancha | Introducir la biopsia en un contenedor con una pequeña cantidad de suero fisiológico estéril. NO usar formol. |
Catéter | Bacterias/hongos (cultivo) |
Envase estéril de boca ancha | Segmento distal de no más de 4 cm de longitud. Enviar en sospecha de infección asociada a catéter, siempre junto con hemocultivo No solicitar cultivo sistemáticamente cada vez que se retire un catéter |
Catéter urinario | No aceptable | ||
Catéter drenaje | No recomendable | Enviar líquido drenaje, abscesos, aspirados | |
CTO (cepillado telescopado ocluído) | Bacterias, hongos (cultivo) |
Envase estéril de boca ancha | CTO: añadir 1 ml de suero fisiológico estéril |
Esputo espontáneo, esputo inducido | Bacterias, hongos (cultivo) |
Envase estéril de boca ancha | Volumen: 3-5 ml. Es recomendable enviar el primero de la mañana, tras enjuague de la boca con agua. |
Micobacterias (tinción, cultivo, PCR) | Envase estéril de boca ancha | Volumen: 5-10 ml. Enviar muestras de tres días consecutivos (preferible primera de la mañana) | |
Exudado conjuntival/corneal | Bacterias, hongos (cultivo) | Torunda en medio líquido de Stuart o Amies, o inocular en tioglicolato | |
Exudado endocervical | Chlamydia trachomatis/gonococo (PCR) | Torunda en medio líquido de Stuart o Amie | |
Bacterias (cultivo) | Torunda en medio líquido de Stuart o Amies | Enviar inmediatamente al laboratorio | |
VPH (PCR) | Torunda con medio de transporte de virus (UTM) | ||
Exudado faríngeo | Bacterias, hongos (cultivo) | Torunda en medio líquido de Stuart o Amies | |
PCR virus / FilmArray | Torunda con medio de transporte de virus (UTM) | ||
Exudado nasal | S. aureus (cultivo) | Torunda en medio líquido de Stuart o Amies | Solicitar para estudio de portadores de Staphylococcus aureus. Tomar muestra de ambas fosas nasales. |
Bacterias (cultivo) | Torunda en medio líquido de Stuart o Amies | Tomar muestra de ambas fosas nasales | |
Exudado / aspirado nasofaríngeo | PCR virus / FilmArray | Torunda con medio de transporte de virus (UTM) | |
Exudado oído externo | Bacterias / hongos (cultivo) | Torunda en medio líquido de Stuart o Amies | |
Exudado rectal | Bacterias (cultivo) | Torunda en medio líquido de Stuart o Amies | No conservar en nevera si se sospecha ITS |
Chlamydia trachomatis/gonococo (PCR) Virus (PCR) |
Torunda en medio líquido de Stuart o Amies. Para virus medio de transporte para virus (UTM) | ||
Exudado uretral | Chlamydia trachomatis/gonococo (PCR) | Torunda en medio líquido de Stuart o Amies | |
Bacterias (cultivo) | Torunda en medio líquido de Stuart o Amies | No conservar en nevera si se sospecha ITS | |
Mycoplasma hominis Ureaplasma urealyticum (cultivo) |
Torunda en medio líquido de Stuart o Amies | Contactar previamente con el S. de Microbiología | |
Exudado vaginal | Bacterias, hongos (cultivo) | Torunda en medio líquido de Stuart o Amies | No conservar en nevera si se sospecha ITS |
Exudado vagino-rectal | Streptococcus agalactiae (cultivo, PCR) | Torunda en medio líquido de Stuart o Amies | |
Heces | Bacterias (cultivo) | Envase estéril de boca ancha, medio Cary-Blair | |
Toxina de Clostridium difficile (IC/PCR) | Envase estéril de boca ancha | ||
Parásitos (microscopía) Parásitos (inmunocromatografía) |
Transporte con S.A.F. |
3 de 3 días no consecutivos. Para investigación de oxiuros, tomar la muestra mediante técnica de Graham (al levantarse por la mañana y antes de lavarse adherir papel autoadhesivo transparente (papel de celo) por los márgenes anales y pegar sobre una de las caras de un portaobjetos, ajustándose a su medida) | |
Rotavirus, adenovirus, norovirus (IC) | Envase estéril de boca ancha | ||
Heridas, úlceras, quemaduras, mordeduras | Bacterias, hongos (cultivo) | Envase estéril (biopsia), jeringa ocluida (sin aguja), tioglicolato, Torunda con medio de transporte líquido de Stuart o Amies | Tomar la muestra tras limpieza y desinfección adecuada. Siempre que sea posible, obtener la muestra por aspiración. Poco recomendables las recogidas con escobillón, preferible enviar biopsia: introducir la muestra en un contenedor con una pequeña cantidad de suero fisiológico estéril y NO usar formol |
Humor vítreo | Bacterias, hongos (cultivo) | Frasco estéril, jeringa de aspiración | Volumen de muestra muy limitado, priorizar los estudios. Contactar previamente con el S. de Microbiología |
Jugo gástrico | Micobacterias (tinción, cultivo/PCR) | Envase estéril de boca ancha | Envío inmediato, avisar a Microbiología. Siempre que sea posible, no sacar en sábados, domingos ni festivos |
Lentes de contacto | Bacterias, hongos (cultivo) Parásitos: Acanthamoeba (microscopía, cultivo) |
Enviar lentes en su estuche y también el frasco de líquido de conservación | Envío inmediato, avisar a Microbiología |
Lentes terapéuticas | Bacterias, hongos (cultivo) | Envase estéril de boca ancha / tioglicolato | |
Lesiones fúngicas (piel, pelo, uñas) | Hongos (cultivo) | Envase estéril / placa de Petri | |
Líquido amniótico | Bacterias, hongos (cultivo) | Envase estéril, jeringa ocluida (sin aguja), tioglicolato, frascos de hemocultivo | |
Virus (PCR) | Envase estéril | ||
Líquido cefalorraquídeo | Bacterias (cultivo, Ag de neumococo por IC) | Envase estéril | Enviar inmediatamente al laboratorio. Si no es posible, la muestra para cultivo debe dejarse a temperatura ambiente. Para el resto de estudios puede refrigerarse. Si se extrae más de un tubo, enviar el extraído en segundo lugar a Microbiología. Indicar siempre por orden de preferencia los estudios a realizar |
Hongos (cultivo) | Envase estéril | ||
Virus (PCR) | Envase estéril | ||
Serología (ELISA) | Envase estéril | ||
Parásitos | Envase estéril | ||
Micobacterias (tinción, cultivo, PCR) | Envase estéril | ||
FilmArray | Envase estéril | ||
Líquidos estériles (articular, ascítico, bilis, pericárdico, peritoneal, pleural) | Bacterias (cultivo) | Envase estéril/frascos de hemocultivo / jeringa estéril ocluida sin aguja | Enviar inmediatamente al laboratorio. Si no es posible, la muestra para cultivo debe dejarse a temperatura ambiente. Para el resto de estudios puede refrigerarse. Indicar siempre por orden de preferencia los estudios a realizar |
Hongos (cultivo) | Envase estéril | ||
Virus (PCR) | Envase estéril | ||
Parásitos | Envase estéril | ||
Micobacterias (tinción, cultivo, PCR) | Envase estéril | ||
Médula ósea | Bacterias / hongos (cultivo) | Envase estéril / frascos de hemocultivo | |
Parásitos: Leishmania (microscopía) | Tubo EDTA | ||
Micobacterias (tinción, cultivo, PCR) | |||
Nódulos genitales | Bacterias (cultivo) | Jeringa / Envase estéril | Aspirado nódulo |
Orina (micción limpia o sondaje) | Bacterias, hongos (cultivo) | Tubo estéril para orinas con conservante | Micción limpia: Preferible primera orina de la mañana. Desechar primera porción de la micción y recoger el resto. |
Antígeno de neumococo / Ag de Legionella (IC) | Tubo estéril para orinas con conservante | ||
Chlamydia / gonococo (PCR) | Tubo estéril para orinas con conservante | ||
Micobacterias (tinción, cultivo) | Tubo estéril para orinas con conservante | Enviar 3 muestras de orina de 3 días consecutivos, con volumen mínimo de 20 ml cada muestra. No enviar muestras de orina de 24 horas |
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Parásitos | Envase estéril de boca ancha | Recoger el mayor volumen posible | |
Orina punción suprapúbica | Bacterias (cultivo) | Jeringa ocluida | Diagnóstico de bacteriuria por anaerobios y de ITU en niños |
Prótesis y material protésico (prótesis articulares, válvulas, port-a-cath…) | Bacterias (cultivo / PCR 16s) Hongos (cultivo) Micobacterias (tinción, cultivo, PCR 16s) |
Contenedor estéril apropiado según tamaño | Añadir un pequeño volumen de suero fisiológico estéril a las piezas pequeñas para evitar su desecación |
Raspado corneal, córnea, casquete corneal | Bacterias / hongos (cultivo) Acanthamoeba (microscopía, cultivo) |
Inoculación directa en medios de cultivo (tioglicolato) Envase estéril |
Contactar previamente con el S. de Microbiología |
Sangre | Hemocultivo | Frascos de hemocultivo | Realizar siempre dos extracciones de sangre (tres en sospecha de endocarditis) de punciones independientes de vena periférica con un intervalo de entre 5 y 60 minutos. En adultos, cada extracción será de 20 ml (10 ml en frasco aerobio y 10 ml en anaerobio, por este orden). Para pediatría e infecciones asociadas a catéter, ver Nota 1. |
Serología | Suero (tubo de gelosa con tapón rojo) | ||
Virus | Plasma (EDTA o K7) | ||
Carga viral | Plasma (EDTA con gelosa “tubo de tapón blanco”) | ||
Parásitos (tinción, IC) | Sangre no coagulada (EDTA) | ||
Micobacterias | Frasco de hemocultivo especial (frasco de hemocultivo con tapón rojo) | Frasco especial para micobacteriosis diseminada o fungemia. Contactar con Microbiología. | |
Secreción prostática | Bacterias, hongos | Envase estéril de boca ancha | |
Semen | Bacterias (cultivo) | Envase estéril de boca ancha | |
Úlceras genitales (frotis) | Virus: VPH, herpes (PCR) | Torunda con medio de transporte de virus (UTM) | Limpiar la lesión con suero salino y presionar la base para recoger fluído |
Válvulas, verrugas cardiacas | Bacterias (cultivo, PCR 16s) Hongos (cultivo) |
Envase estéril de boca ancha | |
Vesículas mucocutáneas | Bacterias (cultivo) |
Aspirado de líquido (jeringa-aspiración)/ Torunda en medio líquido de Stuart o Amies Torunda con medio de transporte de virus (UTM) |
Tras romper la vesícula, frotar el fondo con torunda |
Verrugas genitales | VPH | Torunda con medio de transporte de virus (UTM) |
NOTA 1: BACTERIEMIA RELACIONADA CON EL CATÉTER
Bacteriemia relacionada con reservorio:
Extraer una pareja de hemocultivos por punción venosa directa e inmediatamente después, extraer una segunda pareja de hemocultivos del reservorio (si son bicamerales, se debe realizar una extracción de 20 ml de cada cámara).
Bacteriemia relacionada con catéter venoso central:
Extraer una pareja de hemocultivos por punción venosa directa e inmediatamente después, extraer una segunda pareja de hemocultivos de la luz 1 y otra de la luz 2.
IMPORTANTE
- En adultos, el volumen de sangre a inocular en cada frasco es de 10 ml. En niños, el volumen adecuado se indica en la siguiente tabla:
Peso <4 kg 4-9 Kg 10-14 Kg 15-20 Kg 21-40 Kg >40 Kg |
Volumen en cada extracción 1 ml 2 ml 3 ml 4 ml 5 ml 10 ml |
Tipo de frasco Pediátrico Pediátrico Pediátrico Adulto (aerobio) Adulto (aerobio) Adulto (aerobio) |
- Identificar los frascos de hemocultivos con la pegatina del paciente y rotular la procedencia de la sangre inoculada: venopunción 1ª, venopunción 2ª, luz (indicando cual), reservorio.
- Debe inocularse la misma cantidad de sangre en todos los frascos.
- Enviar lo más rápidamente posible al laboratorio de microbiología, y todos los frascos a la vez.
- En una única petición DIRAYA podemos incluir en el laboratorio hasta 3 parejas de hemocultivos: por tanto NO es necesario hacer una petición para cada pareja.
- Si este protocolo se realiza correctamente, la sensibilidad y la especificidad son elevadas, pero si no se realiza bien puede llevar a conclusiones erróneas, por lo que no debe hacerse si no existen las condiciones óptimas para ello.